تعمل مشفى الأطفال التخصصي على تقديم كافة الخدمات الطبية لأهالي مدينة الرقة وريفها وبشكل مجاني، حيث تضم المشفى ٣ عيادات أطفال وعيادة جراحة وقسم أشعة ومخبر وصيدلية، وقسم الإسعاف القائم على مدار الـ ٢٤ ساعة، وقسم العمليات الجراحية الخاصة بالأطفال، وأيضاً قسم حواضن يضم ٣٠ حاضنة و١٠ غواصات للأطفال حديثي الولادة، بالإضافة لعمل المشفى مؤخراً على افتتاح قسم عزل لاستقبال الحالات المعدية للأطفال.